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Genes que codifican factores de trascripción responsables de la activación de otros genes; se expresan en momentos y lugares determinados y son los responsables de la diferenciación de las células para formar un tipo de tejido u otro; muchos de ellos contienen una secuencia de ADN, llamada homeobox, que codifica un segmento proteínico de unos 60 aminoácidos conocido como homeodominio; los homeogenes presentan un grado de conservación evolutivo enorme, puesto que aparecen desde moscas hasta ratones y humanos pasando por calamares y ranas (500 millones de años de distancia evolutiva).

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